Per prima cosa (se non è già presente sul sistema in uso) installare ntfsprogs
Da Terminale: sudo apt-get install ntfsprogs
Poi, assicurandosi che la partizione in questione non sia montata, per visualizzare l'etichetta del disco ntfs:
ntfslabel <device>
Per modificare l'etichetta:
ntfslabel <device> <label>
Fonte:
http://www.aldolat.it/2008/sistema/gestire-le-partizioni-in-ubuntu/